Zwar ist die hohe Flexibilität und Konfigurierbarkeit von Linux ein Vorteil, kann aber auch als Nachteil betrachtet werden, da hierdurch das Systemgefüge durch den Anwender zerstört werden kann. Während Windows den Nutzer meist bevormundet, bevor er Schaden anrichtet, lässt Linux den Nutzer häufig gewähren, sodass man genau wissen sollte, was man tut.
Darüber hinaus ist auch die Software-Auswahl bei Linux deutlich eingeschränkter als bei Windows. Es gibt zwar einige alternative Produkte für Linux wie Gimp (Alternative für Photoshop) oder LibreOffice (Alternative für Microsoft Office), doch nicht für alle Anwendungen findet man passende Software. Dies trifft auch auf die Spieleauswahl zu. Mittlerweile läuft Steam recht problemfrei unter Linux, wodurch dem Nutzer eine große Spielevielfalt zur Verfügung steht, jedoch ist sie trotzdem nicht mit Microsoft zu vergleichen.
Zwar bieten Softwareumgebungen wie Wine auch die Möglichkeit, Microsoft-Software unter Linux zu installieren, allerdings können trotzdem Leistungseinbußen entstehen.
Außerdem sollten vor allem Gamer auch die Treiberauswahl für Grafikkarten beachten. Während es unter Windows sowohl für AMD-, als auch für nVidia-Grafikkarten offizielle und bestens abgestimmte Treiber gibt, sind für Linux neben den offiziellen Treibern auch Open-Source-Treiber verfügbar, die je nach Anwendungsfall besser oder schlechter funktionieren können. In der Community ergibt sich derzeit das Bild, dass AMD-Grafikkarten etwas besser unterstützt werden als die GPUs von nVidia.
Während Linux früher nur etwas für Entwickler und echte IT-Nerds war, hat es sich über die letzten Jahre hin zu einem echten Allround-Betriebssystem entwickelt.
Vor allem durch die individuell einstellbaren Oberflächen und die umfangreichen Konfigurationsmöglichkeiten ist Linux eine sehr interessante Alternative für Nutzer, die mit ihrem System produktiv arbeiten und sich von Microsoft Windows eingeschränkt fühlen.
Auch die Spielekompatibilität hat sich sehr positiv entwickelt, sodass viele Spiele einschränkungsfrei unter Linux funktionieren, auch wenn Installation und Einrichtung teilweise etwas mehr Aufwand erfordern. Daher kommt es ganz darauf an, für welche Anwendungsgebiete der PC bzw. das Notebook gedacht ist.
Um niemanden ein Betriebssystem aufzuzwingen, sind Gaming-Notebooks und -PCs von Nexoc. auch ohne Betriebssystem erhältlich, sodass jeder Kunde selbst entscheiden kann, welches Betriebssystem er installieren möchte. Gerade für Linux-Interessierte sind Gaming-Rechner ohne vorinstalliertes Betriebssystem sehr interessant, da sie sich beim Kauf des PCs bzw. Notebooks die Lizenzkosten für Windows sparen können.